86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2363 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  141  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  140  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  59.26 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  55.56 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  55.56 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  50.94 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  50.94 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  46.3 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  53.06 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  53.06 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  44.44 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  50.94 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  46.27 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  48.98 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  54.17 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  48.98 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 		 74 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  46.3 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  55 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  40.28 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  45.1 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  48 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  48 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  48.98 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  48.98 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  55.26 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  49.06 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  41.51 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  49.06 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  48 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  57.89 
 
 		 55 aa  48.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  42.59 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  37.04 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  43.14 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  36.76 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  44.07 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  55.1 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  45.28 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  48.78 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  43.1 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  51.11 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  40.82 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  33.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  48.15 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  48.15 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  44.68 
 
 		 64 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  38.3 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  34.43 
 
 		 135 aa  43.9  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  36.17 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  35.94 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2098  hypothetical protein  48.78 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  43.48 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  36.51 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  38.6 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  33.96 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  39.29 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  45.65 
 
 		 76 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  39.22 
 
 		 81 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  38.18 
 
 		 113 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  37.74 
 
 		 70 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  41.67 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  37.04 
 
 		 137 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  36 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  58.33 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  37.74 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  34.29 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2115  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.592477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  40 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>