100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0378 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  148  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  47.14 
 
 
71 aa  68.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  44.29 
 
 
67 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  44.29 
 
 
67 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  45 
 
 
79 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  45 
 
 
79 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  38.46 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1496  protein of unknown function UPF0150  41.43 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815263  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1469  protein of unknown function UPF0150  41.43 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  42.25 
 
 
67 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  47.17 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1740  hypothetical protein  41.43 
 
 
66 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0186698  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  41.27 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  46.3 
 
 
72 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  46.3 
 
 
72 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  43.1 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  46.15 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  54.35 
 
 
73 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  46.94 
 
 
69 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  37.31 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  37.31 
 
 
67 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  45.28 
 
 
74 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  39.66 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  56.82 
 
 
71 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  56.82 
 
 
71 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  38.18 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  37.74 
 
 
68 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  37.74 
 
 
68 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  43.14 
 
 
72 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  35.71 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  46.81 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  42.22 
 
 
48 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  38.89 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  41.07 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  33.8 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  32.43 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  31.94 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  33.93 
 
 
68 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  31.67 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  41.67 
 
 
133 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  37.04 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  35.29 
 
 
87 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  36 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  37.5 
 
 
55 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  38.89 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  31.08 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 
71 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  32.76 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  31.08 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  39.53 
 
 
56 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  39.53 
 
 
56 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  31.08 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.08 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  31.08 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  31.08 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  32.76 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  31.08 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  31.08 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  31.82 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  33.96 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  37.74 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  41.67 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  35.29 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  39.13 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  38 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  31.43 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  32.2 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  37.84 
 
 
74 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  39.66 
 
 
113 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  39.62 
 
 
74 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  46.51 
 
 
86 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  30.51 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  38.1 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  30.51 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  32.08 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  32.73 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  42.55 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  31.88 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  34.69 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  30.36 
 
 
121 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  32.08 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  30.91 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  44.12 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  41.86 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  35.09 
 
 
75 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>