39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1096 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  100 
 
 		 48 aa  97.8  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  75.51 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  66.67 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0379  protein of unknown function UPF0150  59.18 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201735  hitchhiker  0.00342106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  51.11 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  48.94 
 
 		 79 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  48.94 
 
 		 79 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  42.22 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  44.19 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  45.45 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  47.62 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  45.24 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  48.78 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  48.78 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  44.19 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  39.53 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  41.86 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  43.18 
 
 		 131 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  53.85 
 
 		 81 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  56.67 
 
 		 142 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  45.24 
 
 		 56 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  45.24 
 
 		 56 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  35.42 
 
 		 82 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  35.42 
 
 		 72 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  46.34 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  45.24 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  58.62 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  47.22 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  43.18 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  45.45 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>