141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3872 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
121 aa  247  5e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  54.92 
 
 
121 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  53.28 
 
 
121 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  46.61 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  49.54 
 
 
130 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  54.81 
 
 
122 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  48.15 
 
 
116 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  46.22 
 
 
187 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  45.54 
 
 
160 aa  97.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  47.71 
 
 
113 aa  97.1  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  43.43 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  40.68 
 
 
118 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  38.38 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  38.83 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  52 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  52 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  48.15 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  28.1 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  48.28 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  39.13 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  43.86 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  48.39 
 
 
67 aa  57.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  48.08 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  48.08 
 
 
56 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  30.84 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  30.77 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  27.52 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1472  hypothetical protein  30.25 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  34.29 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  29.91 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  44.07 
 
 
71 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  48.21 
 
 
71 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  52.73 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  48.21 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  37.84 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  29.7 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  47.06 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  48.21 
 
 
75 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  47.06 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2034  hypothetical protein  35.11 
 
 
122 aa  50.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000850419  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  35.87 
 
 
115 aa  50.1  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  38.57 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  49.12 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  39.06 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  50 
 
 
48 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  31.25 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
212 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  28.46 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  49.12 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  36.51 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  41.07 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  46.43 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  29.27 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  40.62 
 
 
135 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  46.43 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  41.07 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  43.64 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.33 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  34.33 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  41.94 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  38.98 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  41.3 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  34.33 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  34.33 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  34.33 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  34.33 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  29.49 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 
72 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  44.07 
 
 
65 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 
134 aa  47  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 
68 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  27.27 
 
 
137 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 
68 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  29.36 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  52.63 
 
 
117 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  52.63 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  28.43 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  32.93 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  30 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  34.33 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  31.25 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  37.93 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  36.51 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  36.51 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  33.9 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  41.38 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0619  hypothetical protein  39.56 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0263664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  28.95 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  39.34 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  29.93 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>