152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2076 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 142 aa  290  5e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  50.39 
 
 		 137 aa  141  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  49.25 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  48.44 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  47.69 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  46.09 
 
 		 137 aa  124  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  47.69 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  47.66 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  44.62 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  41.54 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  45.38 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  43.65 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  44 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  47.2 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  39.69 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  36.8 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  42.19 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  38.93 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  36.92 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  36.72 
 
 		 133 aa  91.3  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  36.15 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  41.32 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  40.62 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  44.71 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  32.41 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  35.16 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  35.16 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  35.16 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  34.23 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  33.08 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  35.96 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  33.82 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  34.13 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  32.85 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  48.28 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  35.94 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  34.38 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  37.5 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  46.27 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  29.71 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  36.96 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  30.43 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  32.54 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  28.37 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  41.43 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  52.83 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  34.31 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  30.83 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  30.83 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  29.1 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  31.63 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  39.24 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  32.28 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  45.45 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  30.47 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  39.19 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  48.44 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  32.69 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  53.33 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  39.68 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  35 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  37.14 
 
 		 68 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  40.62 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  56.1 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  41.27 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  39.39 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  41.27 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  31.31 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  45.1 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  45.1 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  37.88 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  38.1 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  52.17 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  40.62 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  28.46 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  32.73 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  30.33 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  36.51 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  39.68 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  38.6 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  40.32 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  38.1 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  42.37 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  38.1 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>