133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1308 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  146  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  65.33 
 
 
78 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  66.67 
 
 
48 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  52.38 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  52.38 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0379  protein of unknown function UPF0150  45.33 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201735  hitchhiker  0.00342106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  47.27 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  43.48 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  47.17 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  48.28 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  49.06 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  43.86 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  41.27 
 
 
72 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  57.8  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  48.15 
 
 
81 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  41.43 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  42.37 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  40 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  47.37 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  47.37 
 
 
71 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  55.56 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  47.06 
 
 
72 aa  53.9  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  44.29 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  55.56 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  43.86 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  37.93 
 
 
71 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  39.39 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  53.33 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  35.82 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  43.64 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  29.33 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  40.62 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  55.56 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  37.31 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  40.32 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  35.48 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  36.84 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  38.33 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  42.59 
 
 
72 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  44.68 
 
 
138 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  46.3 
 
 
72 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  38.33 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  46.3 
 
 
72 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  34.43 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  39.66 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  37.88 
 
 
68 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  45.76 
 
 
68 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  43.48 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  45.76 
 
 
68 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  42.37 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  37.74 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  51.02 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  45.28 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  32.31 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  39.29 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  38.18 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  41.79 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  43.75 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  46 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
72 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  45.24 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  36.84 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  37.5 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  35.09 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  37.29 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  42.31 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  44.19 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  36.36 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  37.14 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  36.36 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  38.46 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  38.81 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  48.94 
 
 
212 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  38.81 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  34.25 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  37.04 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  34.48 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  42.59 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  37.74 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  35.09 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  33.93 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  34.29 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  32.81 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  34.62 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  39.58 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  30.65 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  38 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  30.3 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>