128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0567 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  258  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  75 
 
 		 131 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  77.34 
 
 		 132 aa  201  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  50.79 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  40.77 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  44.78 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  44.36 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  47.5 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  43.38 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  42.97 
 
 		 142 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  38.4 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  39.68 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  40.94 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  36.92 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  41.86 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  38.93 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  40.91 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  51.47 
 
 		 98 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  38.81 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  34.38 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  36.69 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  34.19 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  36.72 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  35.16 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  38.4 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  37.82 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  35.82 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  38.66 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  31.82 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  34.35 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  40.5 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  34.65 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  37.1 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  32.84 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  43.96 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  36 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  36.84 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  49.18 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  37.6 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  30.33 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  46.03 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  47.22 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  45.56 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  31.5 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  43.48 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  39.08 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  30.08 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  44.44 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2022  hypothetical protein  44.09 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  48.39 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  43.75 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  44 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  43.28 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  39.13 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  34.29 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  41.38 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  32.23 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  46.51 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  31.36 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  31.36 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  31.36 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  28.36 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  46.43 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  41.79 
 
 		 78 aa  52.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  32 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  41.82 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  31.93 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  36 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  38.1 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  38.1 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  40 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  36.51 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  45.76 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  36.51 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  44.23 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3369  hypothetical protein  63.64 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  37.29 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  45.1 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  50 
 
 		 56 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  30.68 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  34.43 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2448  CopG domain protein DNA-binding domain protein  29.13 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  31.67 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  41.86 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  31.67 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  47.73 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>