139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1725 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  65.12 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  44.88 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  39.84 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  44.35 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  37.69 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  41.73 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  42.06 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  39.69 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  38.93 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  37.96 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  41.86 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  42.06 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 136 aa  85.5  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  38.4 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  40.68 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  37.98 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  37.98 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  37.98 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  38.93 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  37.69 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  36.92 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  37.88 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  31.88 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  36.64 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  35.66 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  37.4 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  55 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  37.98 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  32.59 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  32.59 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  33.06 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4420  hypothetical protein  34.15 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  32.8 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  43.86 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  33.61 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  30.77 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  33.08 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  33.08 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  33.08 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  29.55 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  32.31 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  56.1 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  43.1 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  40.35 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  30.65 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  40.35 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  44.23 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  39.51 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  29.77 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  25.83 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  43.75 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  30.4 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  31.75 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  28.81 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  39.58 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  47.92 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  42.31 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  34.91 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  47.73 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  44.64 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  44.19 
 
 		 48 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  34.43 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  46.15 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  35.21 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  41.3 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  33.8 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  41.86 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  43.48 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  36.92 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  35 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  31.36 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  28.8 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  43.75 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  42.22 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  37.5 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  22.22 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  53.49 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  34.55 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  23.53 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>