19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4420 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4420  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  292  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  51.09 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  51.09 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  48.57 
 
 		 171 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  48.55 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1685  hypothetical protein  42.53 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  34.15 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  29.84 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  29.37 
 
 		 132 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  26.61 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0550  hypothetical protein  48.08 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  28.46 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6926  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  27.56 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  26.98 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  26.19 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  27.69 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  27.69 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  27.69 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>