98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2933 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  284  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  53.38 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  44.78 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  44.03 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  38.97 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  41.79 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  37.21 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  35.66 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  38.93 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  36.57 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  30.51 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  36.15 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  34.62 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  37.12 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  35.38 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  32.12 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  32.12 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  32.12 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  34.59 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  35.66 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  38.66 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  34.06 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  31.11 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  36.57 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  33.82 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  32.85 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  35.66 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  36.67 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  31.82 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  34.58 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  41.79 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  33.64 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  33.08 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  34.35 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  34.31 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  44.26 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  31.58 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  30.4 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  31.13 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  30.6 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  29.03 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  31.06 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  46.81 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  30.16 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  30.16 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  30.16 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  30.16 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  30.16 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  38.98 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  28.68 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  28.42 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  32.31 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  36.17 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  33.87 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5266  hypothetical protein  24.24 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5593  hypothetical protein  24.24 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  30.36 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  30.36 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  33.73 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  25 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  33.93 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  34.38 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  29.63 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  28.57 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  35.71 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  35.19 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.85 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  34.85 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  34.85 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  34.85 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  34.85 
 
 		 145 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  31.67 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  38.3 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  36.17 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4876  hypothetical protein  36.51 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  29.09 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  30.65 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4420  hypothetical protein  26.19 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  28.85 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  34.69 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1712  hypothetical protein  24.24 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>