82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1569 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  254  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  40.77 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  41.09 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  37.21 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  37.21 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  37.21 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  36.72 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  35.66 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  34.88 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  35.94 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  31.75 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  33.85 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  31.4 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  32.99 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  29.01 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  31.2 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  32.35 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3797  hypothetical protein  28.12 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  31.2 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  31.97 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  41.67 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  28.68 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2094  protein of unknown function UPF0150  27.48 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000245077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  38.71 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  34.85 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  34.29 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  32.11 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  41.38 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  40 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  28.32 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  29.09 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  36.67 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  38.98 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  29.27 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  38.81 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  29.25 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  34.43 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  39.62 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  33.85 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  37.7 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  44 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  27.88 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  27.03 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  27.03 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  24.56 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  27.03 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.03 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  27.03 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  27.03 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  27.03 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  45.65 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  35.19 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  28.79 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  34.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  32.79 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  35.71 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  34.85 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  30.91 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  25.58 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  30.91 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  36.21 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  25.61 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  30.43 
 
 		 130 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 		 78 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  39.13 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  25.26 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  26.02 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1294  hypothetical protein  31.03 
 
 		 87 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.289412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>