35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4580 on replicon NC_009998
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  310  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  98.01 
 
 		 151 aa  304  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  98.01 
 
 		 151 aa  304  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  98.01 
 
 		 151 aa  304  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  96.69 
 
 		 151 aa  300  3.0000000000000004e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  81.94 
 
 		 144 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  42.55 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  38.78 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  31.21 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  32.62 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  33.09 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  31.21 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  29.63 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 136 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  31.11 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  33.6 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  31.62 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  31.47 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  30.16 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  30.43 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  27.46 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  28.44 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  29.91 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  29.91 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  29.91 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  28.17 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  30.58 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  30.65 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  29.41 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  25.55 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  26.36 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  25.41 
 
 		 129 aa  40  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>