79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4023 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  82.29 
 
 		 96 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  42.86 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  46.15 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  51.67 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2022  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  50.68 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  44.74 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  37.23 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  39.76 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  42.47 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  47.95 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  44.29 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  38.04 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  44.83 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  46.05 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  39.24 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  41.03 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  34.48 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4022  protein of unknown function UPF0150  46.88 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  41.1 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  42.37 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  45.45 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  43.24 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  40.58 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  44.83 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  38.16 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  36.59 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  34.25 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  36.62 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  43.1 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  40.62 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  30.38 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  40.62 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  62.5 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  40.62 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  47.27 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  39.29 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  31.51 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  39.24 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  33.85 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  38.03 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  34.21 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  34.38 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  45.24 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0651  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  45.24 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  35.71 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  35.48 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  35.14 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  38.03 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  40.82 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  44.19 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  38.78 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  37.31 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  25.26 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  41.18 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  28.17 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3369  hypothetical protein  37.23 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  48.65 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  40.96 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  41.86 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  41.86 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  41.86 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  42.55 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  36 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  29.63 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 75 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>