73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2907 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  206  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  50.59 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  51.76 
 
 		 136 aa  100  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  45.35 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  44.71 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  43.16 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  47.13 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  45.98 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  41.18 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  48.24 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  43.02 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  43.02 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  55 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  40 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  37.78 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  48.57 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  36.67 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  38.04 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  44.12 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  35.05 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  47.95 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  45.59 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  43.28 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  35.29 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  50.79 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  42.47 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  32.58 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  48.08 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  36.23 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  44.23 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  38.57 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  33.72 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  42.59 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  31.4 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  45.76 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  46.81 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  45.76 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  40.3 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  44.83 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  44.83 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  43.1 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  44.19 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  43.1 
 
 		 72 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  31.25 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  36.76 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0134  hypothetical protein  31.52 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501544  normal  0.0368693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  46 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  42.31 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  42.11 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  35.48 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  43.14 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  35.48 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  34.33 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  29.51 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  29.79 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  33.85 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  33.87 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  42.55 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3280  hypothetical protein  33.77 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  36.36 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  38.46 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  34.48 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>