106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1738 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  255  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  40.31 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  36.8 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  30.3 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  28 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  32.8 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  32.79 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  31.11 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  36.19 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  32 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  34.35 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  38.24 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  49.21 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  37.86 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  30.71 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  34.38 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  35.96 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  31.01 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  29.77 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  32.84 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  38.36 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  44.62 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  29.01 
 
 		 119 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  31.75 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  32.28 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  28.79 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4214  hypothetical protein  46.77 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  29.03 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  29.03 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  29.03 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  28.09 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  42.67 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  29.85 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  33.82 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  30 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  46.55 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  40.62 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3659  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  46.97 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  37.68 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  44.07 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0802  hypothetical protein  38.98 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.376551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  28.46 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  29.46 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  31.45 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  36.49 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  37.14 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  31.5 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  31.34 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  31.78 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0585  hypothetical protein  40.62 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290955  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  26.87 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 		 79 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 		 79 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4389  hypothetical protein  46.15 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.400266  normal  0.0706735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  44.23 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2369  hypothetical protein  37.31 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00651332  normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  29.41 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  35.06 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  31.03 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  36.62 
 
 		 93 aa  48.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  30.16 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  30.47 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0619  hypothetical protein  28.46 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0263664  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  26.09 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  25.78 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  40.98 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  27.54 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2448  CopG domain protein DNA-binding domain protein  30.7 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  32.14 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  34.55 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  23.48 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  28.7 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  36.54 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  31.94 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  23.48 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  38.1 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  35.19 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  35.19 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  28.72 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  35.94 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  35 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  32.65 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  28.8 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  34.62 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  28.33 
 
 		 75 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  34.55 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  25.69 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>