17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0619 on replicon NC_009795
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009795  CCC13826_0619  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  235  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0263664  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  48.7 
 
 
119 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  48.7 
 
 
115 aa  105  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1472  hypothetical protein  45.3 
 
 
116 aa  89.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  41.11 
 
 
121 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  41.11 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2034  hypothetical protein  34.48 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000850419  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  41.89 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  34.02 
 
 
122 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  39.56 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  28.46 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  30.51 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  37.93 
 
 
113 aa  47  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  37.84 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  38.36 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  25.19 
 
 
137 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>