135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2645 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  275  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  61.54 
 
 		 131 aa  163  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  59.23 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  50.38 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  50.39 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  45.8 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  41.35 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  44.62 
 
 		 137 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  42.64 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  41.54 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  41.73 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  39.23 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  40.77 
 
 		 150 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  37.98 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.96 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  36.15 
 
 		 134 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  33.83 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  37.4 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  38.93 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  35.38 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  45.98 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  38.58 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  38.39 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  35.07 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2305  hypothetical protein  32.06 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  37.04 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0138  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00419198  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  53.23 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  36.76 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  34.43 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  36.22 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  43.55 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2598  hypothetical protein  25.19 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0800472  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  31.4 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  38.94 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  43.94 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  32.8 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  36.97 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0032  hypothetical protein  30.37 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.475298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  28.1 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0042  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.567863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  29.01 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4418  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200049  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4601  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0107991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4409  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.901332 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4580  hypothetical protein  29.63 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0417201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  33.58 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3308  hypothetical protein  27.94 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0972  hypothetical protein  27.94 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3439  hypothetical protein  27.94 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  30.51 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  33.06 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  42.25 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3760  hypothetical protein  32.82 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  29.46 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  40.32 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  28.12 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  26.36 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  25.38 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  43.64 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  31.58 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  30.1 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  27.21 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  46.81 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  31.52 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  43.48 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  31.43 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  40.32 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3887  hypothetical protein  22.63 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  40.32 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  38.89 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  44.26 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  45.45 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  30.59 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  36.07 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  38.78 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  37.29 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  35.59 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  39.39 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  40.62 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  34.44 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  33.33 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  42.42 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  36.67 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  28.83 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  35.94 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  35.94 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>