67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0481 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  233  6e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  44.25 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  45.37 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  47.71 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  44.44 
 
 		 187 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  43.14 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  45.05 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  44.95 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  43.81 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  43.12 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  38.68 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  41.24 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  39.05 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  40.21 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  36 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  36.14 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  35 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  39.29 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  37.14 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  30.68 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  36.9 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  45.65 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  43.75 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  26.61 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  36.23 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  28.43 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  32.39 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0463  hypothetical protein  40.62 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  31.08 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1506  hypothetical protein  39.58 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0732212  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  34.44 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  32.86 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  29.21 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  55.1 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  40.38 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  30.95 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  24.73 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  30.34 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  39.66 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  39.66 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  33.8 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  38.3 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  53.19 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  26.97 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  53.19 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  31.87 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  36.76 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  23.66 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  32.65 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2368  hypothetical protein  39.62 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00633601  normal  0.0946995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  42.5 
 
 		 136 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  42.55 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1472  hypothetical protein  32.58 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  41.3 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  36.17 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  31.08 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  43.75 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  40 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  45.45 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  39.22 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>