107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2428 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  249  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  64.66 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  64.66 
 
 		 121 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  52.89 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  48.03 
 
 		 187 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  48.28 
 
 		 130 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  45.95 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  45.37 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  41.38 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  40.87 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  40.54 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  39.45 
 
 		 116 aa  88.2  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  43.01 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  41.75 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  35.9 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  48.78 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0619  hypothetical protein  38.79 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0263664  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  41.1 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  46.38 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  45.9 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  48.39 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  38.54 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  48 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  37.5 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2034  hypothetical protein  37.63 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000850419  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  55 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  48.89 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  55 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1472  hypothetical protein  33.06 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  40.3 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  40 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  40.3 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  46.81 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  40.91 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  31.96 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  35.94 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  45.28 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  42.62 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  46.94 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  45.65 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  45.65 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  46.94 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  41.51 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  36.36 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  42.37 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  42 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  36.76 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  42.59 
 
 		 56 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  42.59 
 
 		 56 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  42.31 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  41.54 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  41.54 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  42.31 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  36.67 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  36.67 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  36.51 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  38.6 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2098  hypothetical protein  38.1 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  36.14 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  43.14 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1526  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 223 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  45 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  47.37 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1096  hypothetical protein  46.67 
 
 		 48 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  38.6 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1787  hypothetical protein  37.68 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271527 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1469  protein of unknown function UPF0150  36.73 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1496  protein of unknown function UPF0150  36.73 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  43.59 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  32.79 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  27.69 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  38.78 
 
 		 74 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  37.25 
 
 		 72 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0463  hypothetical protein  33.85 
 
 		 119 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 68 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  40.43 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  30.86 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  39.58 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  29.58 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  34 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  35.29 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>