117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1684 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  273  7e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  59.38 
 
 		 118 aa  89.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  37.93 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  49.41 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  43.3 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  59.32 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  40.21 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  50.82 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  48.75 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  53.23 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  49.18 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2098  hypothetical protein  42.03 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  46.77 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  37.38 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  40.23 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  36.14 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  56.6 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  38.1 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  40.62 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  46.77 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  45.31 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  43.86 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  45.9 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  37.1 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  48.21 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  52 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  45.16 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  40.28 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  37.84 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  56.76 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  56.76 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  55 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  55 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  52.27 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  52.27 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  35.48 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  45 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  44.9 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  39.22 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  40.32 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  45.76 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  41.18 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  41.3 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  38.81 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2933  hypothetical protein  28.68 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  39.22 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  51.35 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  45 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  35 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  45.1 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  51.16 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  45.1 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  51.16 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  42.22 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  44.23 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  40.62 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  45 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  44.23 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  41.82 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  41.67 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  43.75 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  39.58 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2298  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0522816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  40.38 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  41.3 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  37.14 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  47.83 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  37.1 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  41.3 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  42.22 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  37.1 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.35 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  37.93 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  46.15 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  39.22 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  38.1 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  40.98 
 
 		 137 aa  42  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  32.35 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  32.35 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  32.35 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>