86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0564 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  100 
 
 		 147 aa  306  8e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  59.65 
 
 		 116 aa  144  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  46.61 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  43.65 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  40.98 
 
 		 187 aa  95.5  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  43.97 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  38.84 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  45.05 
 
 		 113 aa  90.1  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  38.18 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  39.8 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  40.82 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  46.77 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  30.51 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  38.18 
 
 		 72 aa  51.2  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  44 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  40.62 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  34.69 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  36.67 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  39.62 
 
 		 56 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  39.62 
 
 		 56 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  42.86 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  32.97 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  38.6 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  41.18 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  31.63 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0600  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  44 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  40.43 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  40.98 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  45.83 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  32.26 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  38.64 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  39.06 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  39.22 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  34.29 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  30.61 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  47.62 
 
 		 113 aa  42.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  27.34 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  34.43 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  45.24 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  39.66 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  23.53 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  46.15 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  28.17 
 
 		 74 aa  42.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  27.71 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  46.34 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  34.38 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  38.46 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  36.54 
 
 		 71 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  39.13 
 
 		 113 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  36.54 
 
 		 71 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 		 136 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  30.19 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  31.48 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  47.22 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  30 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  25.89 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1311  hypothetical protein  51.43 
 
 		 78 aa  40.8  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  48.39 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2098  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  22.95 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  31.25 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  36.36 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  50 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  34.33 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  44.74 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  32.26 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  32.14 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  32.58 
 
 		 139 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  40 
 
 		 108 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>