93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3460 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
121 aa  250  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  96.69 
 
 
121 aa  242  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  64.66 
 
 
122 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  53.28 
 
 
121 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  42.5 
 
 
187 aa  105  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  44.74 
 
 
130 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  43.52 
 
 
118 aa  102  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  44.44 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  45.54 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  39.13 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  37.39 
 
 
135 aa  86.7  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  43.12 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  36.7 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  37.07 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  38.2 
 
 
119 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  36.7 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  50.82 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  38.64 
 
 
115 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  46.77 
 
 
65 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  34.86 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  46.88 
 
 
70 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  40.91 
 
 
137 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  34.58 
 
 
122 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  43.08 
 
 
70 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  46.77 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  49.02 
 
 
70 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  49.02 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  49.02 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  47.17 
 
 
71 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  46 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  47.06 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 
71 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  45.1 
 
 
69 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0619  hypothetical protein  41.11 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0263664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  40 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  34.12 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  42 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  39.44 
 
 
107 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  48.89 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  36.92 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  48.89 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  38.33 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  40.32 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  42.62 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1008  hypothetical protein  40.68 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296536  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  35.14 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  34.69 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  37.5 
 
 
139 aa  47  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1435  hypothetical protein  42.11 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.374935  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  37.66 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  41.3 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  40.35 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  41.3 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  26 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  27.05 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2034  hypothetical protein  31.58 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000850419  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  41.51 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 
74 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  24.6 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  34.21 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  37.29 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  32.89 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  38.6 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  46 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  38 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1472  hypothetical protein  24.58 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  41.51 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  31.34 
 
 
122 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  34.21 
 
 
110 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  27.85 
 
 
110 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  41.27 
 
 
71 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  43.14 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  38.98 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  34.21 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  28.81 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  34.43 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  29.33 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  36.51 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  30.91 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  26.58 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  28.43 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>