55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1110 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  100 
 
 		 110 aa  221  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  55.14 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  51.89 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  50 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  50 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  48.6 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  39.81 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  46.3 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  37.96 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  39.25 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  39.09 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  38.68 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  37.74 
 
 		 110 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  39.42 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  39.05 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  39.25 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  35.78 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  35.85 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  35.24 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  34.58 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4829  HicB family protein  38.74 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3966  HicB family protein  38.74 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3773  HicB family protein  38.53 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.976848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  33.33 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  33.33 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  28.7 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0256  HicB family protein  33.96 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  33.96 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2664  HicB family protein  35.78 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84692  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  28.44 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  33.98 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  28.44 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  31.63 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  26.85 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  33.73 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  27.52 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  24.3 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  22.43 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  34.92 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  26.17 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  24.07 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  24.76 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  29.87 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  29.87 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  20.37 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  34.21 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  48.72 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1059  hypothetical protein  46.15 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.49551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  32.89 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  48.72 
 
 		 108 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  23.64 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  32.89 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  38.1 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  45.24 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>