63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0059 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  100 
 
 		 108 aa  225  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  68.57 
 
 		 110 aa  158  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  64.81 
 
 		 110 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  63.89 
 
 		 110 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  83.13 
 
 		 83 aa  153  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  62.04 
 
 		 110 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  60.75 
 
 		 110 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  58.33 
 
 		 118 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  52.78 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  46.3 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  45.19 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  42.45 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  40 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  40 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  42.57 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  37.5 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  37.38 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  43.52 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  41.35 
 
 		 105 aa  97.1  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  41.58 
 
 		 117 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  34.26 
 
 		 122 aa  96.7  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  42.57 
 
 		 113 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  37.86 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  38.89 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  41.9 
 
 		 112 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  37.74 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  33.65 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  36.27 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  34.58 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  51.43 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  35.58 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  37.76 
 
 		 112 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  37.76 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  38.89 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  38.16 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  46.27 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  38.16 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  42.86 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  42.86 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  42.86 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  42.86 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  34.29 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  34.29 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  38.03 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  30.48 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0256  HicB family protein  30.48 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  33.65 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  30.51 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  32.35 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  28.97 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  29.36 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  30.1 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  32.97 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  29 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  28.3 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  28.3 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  30.34 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  28.43 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  36.49 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  36.84 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  29.33 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  40 
 
 		 147 aa  40  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>