52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4138 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  100 
 
 		 110 aa  227  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  99.09 
 
 		 110 aa  225  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  91.82 
 
 		 110 aa  213  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  71.82 
 
 		 110 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  63.89 
 
 		 108 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  57.94 
 
 		 110 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  57.41 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  65.06 
 
 		 83 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  42.06 
 
 		 110 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  47.22 
 
 		 111 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  40.57 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  45.71 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  40.57 
 
 		 110 aa  107  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  45.71 
 
 		 105 aa  106  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  42.31 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  40.91 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  37.04 
 
 		 122 aa  98.2  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  44.44 
 
 		 109 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  39.25 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  38.32 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  40.57 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  38.1 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  38.1 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  39.81 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  38.46 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  30.19 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  38.1 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  38.24 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  44.44 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  35.85 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  33.94 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  49.25 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  33.33 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  38.96 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  38.96 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  33.64 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  37.97 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  40 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  40 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  40 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  40 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  34.34 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  34.34 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  31.43 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  27.1 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  30.77 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  34.21 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  26.61 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  34.21 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  34.07 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>