53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2749 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  239  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  46.85 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  45.45 
 
 		 117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  45.45 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  36.94 
 
 		 118 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  40.74 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  40.74 
 
 		 110 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  37.38 
 
 		 110 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  40.95 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  38.68 
 
 		 111 aa  93.2  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  36.45 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  64.62 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  39.05 
 
 		 105 aa  90.5  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  37.27 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  34.29 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  37.38 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  32.08 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  33 
 
 		 110 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  33.65 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  37.14 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  34.82 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  30.19 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  32.69 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  29.25 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  37.61 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  33.02 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  31.73 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  38.89 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  35.78 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  34.29 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  35.44 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  44.29 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  31.19 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  31.19 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  26.85 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  26.21 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  31.58 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  31.58 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  34.72 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  34.72 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  34.72 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  34.72 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  25 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  33.33 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  27.93 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  28 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  32.88 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  26 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  27.96 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  30.95 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  27.78 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  27.88 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  27.35 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>