54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2191 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  100 
 
 		 105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  73.33 
 
 		 105 aa  176  5.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  53.33 
 
 		 110 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  53.33 
 
 		 110 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  52.43 
 
 		 111 aa  121  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  51.43 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  46.15 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  47.62 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  43.81 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  45.71 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  45.71 
 
 		 110 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  44.76 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  44.55 
 
 		 110 aa  105  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  45.19 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  41.35 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  40.38 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  42.31 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  54.55 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  54.55 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  38.83 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  38.83 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  39.05 
 
 		 116 aa  90.5  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  40.38 
 
 		 111 aa  90.9  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  39.6 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  43.04 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  32.69 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  35.24 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  36.63 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  47.76 
 
 		 79 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  34.31 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  34.31 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  34.74 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  31.73 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  31.37 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  35.24 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  41.79 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  30.53 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  34.29 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  33 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  30.1 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  30.1 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  35.48 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  33.82 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  33.82 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  33.82 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  33.82 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  32.11 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  32.11 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  29.91 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  30.77 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  26.97 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  39.71 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  23.81 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0256  HicB family protein  23.81 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>