29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2139 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  100 
 
 		 113 aa  233  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  74.04 
 
 		 109 aa  169  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  65.38 
 
 		 108 aa  147  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  66.67 
 
 		 107 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  63.46 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  35.58 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  31.73 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  35.58 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  30.51 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  32.43 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  31.08 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  28.95 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  34.29 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  30.77 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  31.73 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  25.71 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  31.37 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  29.52 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  29.29 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  29.52 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  38.6 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  58.06 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  58.06 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  39.13 
 
 		 147 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  42.59 
 
 		 187 aa  41.2  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  42.5 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  44.74 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  30.3 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>