57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30660 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  100 
 
 		 110 aa  231  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  71.82 
 
 		 110 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  71.82 
 
 		 110 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  70.37 
 
 		 110 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  68.57 
 
 		 108 aa  158  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  60.75 
 
 		 110 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  53.7 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  67.47 
 
 		 83 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  44.34 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  50 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  44.55 
 
 		 105 aa  105  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  45.54 
 
 		 105 aa  104  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  39.81 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  39.81 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  42.73 
 
 		 111 aa  97.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  41.35 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  40.59 
 
 		 111 aa  94.7  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  37.5 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  39.42 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  35.58 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  39.81 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  38.68 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  33 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  36.19 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  36.19 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  39.42 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  35.24 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  45.21 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  40 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  35.24 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  39.39 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  38.78 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  34.62 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  38.16 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  38.16 
 
 		 77 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  34.86 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  34.86 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  46.27 
 
 		 74 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  38.57 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  38.57 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  38.57 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  38.57 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  31.82 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  31.07 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  36.84 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  29.91 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  29.29 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  31.73 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  35.14 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  35.14 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  29.41 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  31.37 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  29.73 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  29.7 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  32.65 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  28.57 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  35.29 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>