49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3853 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  100 
 
 		 111 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  55.05 
 
 		 110 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  54.63 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  52.78 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  51.85 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  50 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  47.22 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  47.22 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  45.45 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  44.76 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  50.91 
 
 		 111 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  44.76 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  44.23 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  42.31 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  56.63 
 
 		 83 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  42.99 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  49.07 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  41.51 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  39.81 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  43 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  42 
 
 		 112 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  38.89 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  39.25 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  35.92 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  39.8 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  38.32 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  43.24 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  38.89 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  38.78 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  28.44 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  52.24 
 
 		 74 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  40.43 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  37.62 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  36.7 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  44.44 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  39.47 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  39.47 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  38 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  41.67 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  41.67 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  41.67 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  41.67 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  38.53 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  36.79 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  36.79 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  32.5 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0256  HicB family protein  28.04 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  28.04 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  31.73 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>