25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0262 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  100 
 
 		 118 aa  247  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0256  HicB family protein  99.15 
 
 		 118 aa  244  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4829  HicB family protein  45.37 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3966  HicB family protein  45.37 
 
 		 119 aa  110  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2664  HicB family protein  44.95 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84692  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3773  HicB family protein  46.53 
 
 		 110 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.976848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  34.29 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  33.96 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  33.64 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  32.32 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  29.63 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  29.63 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  36.76 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  30.48 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  25.89 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  22.22 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  28.04 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  26.42 
 
 		 118 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  22.22 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  23.81 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  22.12 
 
 		 113 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  25.66 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  28.04 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  30.39 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  24.56 
 
 		 113 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>