17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3966 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3966  HicB family protein  100 
 
 		 119 aa  246  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4829  HicB family protein  100 
 
 		 119 aa  246  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3773  HicB family protein  100 
 
 		 110 aa  228  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.976848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2664  HicB family protein  74.79 
 
 		 119 aa  197  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  45.37 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0256  HicB family protein  45.37 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  42.99 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  41.12 
 
 		 112 aa  80.1  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  41.18 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  38.74 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  35.45 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  35.45 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  39.25 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  26.13 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  31.53 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  32.81 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4137  hypothetical protein  42.22 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969888  normal  0.385246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>