58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4182 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  229  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  72.9 
 
 		 118 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  60.75 
 
 		 108 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  57.94 
 
 		 110 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  60.75 
 
 		 110 aa  147  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  57.94 
 
 		 110 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  56.07 
 
 		 110 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  55.05 
 
 		 111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  75 
 
 		 79 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  61.73 
 
 		 83 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  45.28 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  43.4 
 
 		 110 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  43.4 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  46.15 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  46.23 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  43.81 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  41.35 
 
 		 105 aa  100  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  42.86 
 
 		 116 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  39.45 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  44.86 
 
 		 111 aa  97.1  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  42.59 
 
 		 109 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  39.25 
 
 		 117 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  41.58 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  39.25 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  34.55 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  40.19 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  33.33 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  42.2 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  34.55 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  38.1 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  35.85 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  35.24 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  39.47 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  39.47 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  37.14 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  37.14 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  35.78 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  43.28 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  35 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  30.19 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  34.72 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  34.72 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  34.72 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  34.72 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  31.73 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  32.43 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  31.07 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  29.25 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  29.25 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  27.18 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2664  HicB family protein  32.81 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84692  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  29.25 
 
 		 107 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3966  HicB family protein  32.81 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4829  HicB family protein  32.81 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  31.87 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  32 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>