15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2664 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2664  HicB family protein  100 
 
 
119 aa  246  6e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3966  HicB family protein  74.79 
 
 
119 aa  197  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4829  HicB family protein  74.79 
 
 
119 aa  197  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3773  HicB family protein  77.27 
 
 
110 aa  189  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.976848  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0256  HicB family protein  44.95 
 
 
118 aa  107  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  44.95 
 
 
118 aa  107  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  42.06 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  42.57 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  36.45 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  35.78 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  33.94 
 
 
111 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  33.94 
 
 
111 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  46.88 
 
 
110 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  22.52 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  32.81 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.270938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>