60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0280 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  100 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  57.89 
 
 		 116 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  42.73 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  42.86 
 
 		 113 aa  103  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  41.51 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  37.04 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  42.59 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  39.45 
 
 		 110 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  34.26 
 
 		 108 aa  96.7  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  36.11 
 
 		 110 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  36.11 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  43.14 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  41.35 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  35.58 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  33.33 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  34.58 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  38.39 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  35.85 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  33.96 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  35.85 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  32.69 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  30.19 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  33.96 
 
 		 106 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  37.8 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  29.25 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  33.33 
 
 		 109 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  28.44 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  28.7 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  33.33 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  29.63 
 
 		 111 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  46.88 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  36.92 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  36.92 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  36.92 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  26.92 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  29.91 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  29.91 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  29.36 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  40.91 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  26.03 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  26.03 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  26.03 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  26.03 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  26.61 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  25 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  27.68 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  28.57 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  28.3 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  25.89 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0256  HicB family protein  24.53 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  28.3 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3966  HicB family protein  26.13 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  29.73 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4829  HicB family protein  26.13 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0028  HicB family  50 
 
 		 43 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2664  HicB family protein  22.52 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84692  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3773  HicB family protein  26.26 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.976848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  31.34 
 
 		 121 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  28.7 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>