16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3773 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3966  HicB family protein  100 
 
 		 119 aa  228  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4829  HicB family protein  100 
 
 		 119 aa  228  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3773  HicB family protein  100 
 
 		 110 aa  227  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.976848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2664  HicB family protein  77.27 
 
 		 119 aa  189  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  46.53 
 
 		 118 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0256  HicB family protein  46.53 
 
 		 118 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  42.86 
 
 		 112 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  41.18 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  40.95 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  38.53 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  35.19 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  35.19 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  39.05 
 
 		 110 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  26.26 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  31.19 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4137  hypothetical protein  42.22 
 
 		 201 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969888  normal  0.385246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>