45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1697 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  228  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  60.55 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  57.41 
 
 		 112 aa  130  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  58.18 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  58.18 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  59.09 
 
 		 110 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  48.6 
 
 		 110 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  42.2 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3966  HicB family protein  41.12 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4829  HicB family protein  41.12 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  43.24 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3773  HicB family protein  40.95 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.976848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  38.53 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  40.74 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  38.89 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0256  HicB family protein  33.64 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0262  HicB family protein  33.64 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2664  HicB family protein  36.45 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  33.33 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  33.33 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  33.33 
 
 		 110 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  34.29 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  33.33 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  34.29 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  30.39 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  31.82 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  29.36 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  30.19 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  29.25 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  29.63 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  28.97 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  42.86 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  28.97 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  25.51 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  31.82 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  24.76 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  23.15 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  24 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  25 
 
 		 116 aa  47.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1332  metallophosphoesterase  40 
 
 		 287 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.992901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  32.93 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  23.64 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  50 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  50 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  35.85 
 
 		 110 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>