51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4242 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  100 
 
 		 110 aa  227  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  99.09 
 
 		 110 aa  225  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  92.73 
 
 		 110 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  71.82 
 
 		 110 aa  174  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  64.81 
 
 		 108 aa  157  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  57.94 
 
 		 110 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  57.41 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  66.27 
 
 		 83 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  42.99 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  47.22 
 
 		 111 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  40.57 
 
 		 110 aa  107  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  45.71 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  45.71 
 
 		 105 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  40.57 
 
 		 110 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  41.82 
 
 		 111 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  39.81 
 
 		 110 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  41.35 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  44.44 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  36.11 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  38.32 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  41.18 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  40.57 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  38.1 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  38.1 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  39.81 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  38.46 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  38.1 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  29.25 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  39.22 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  44.44 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  35.85 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  33.94 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  34.29 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  40.26 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  40.26 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  47.76 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  33.64 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  36.71 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  40 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  40 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  40 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  40 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  33.33 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  33.33 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  31.73 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  27.1 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  30.48 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  27.52 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  34.21 
 
 		 121 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  34.21 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>