38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1716 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  53.73 
 
 
118 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  50.75 
 
 
110 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  52.24 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  46.15 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  49.25 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  49.25 
 
 
77 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  49.25 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  50.75 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  47.76 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  46.27 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  46.27 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  44.78 
 
 
110 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  43.28 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  43.28 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  44.78 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  47.76 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  43.28 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  46.27 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  46.27 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  36.92 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  44.78 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  41.79 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  40.3 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  40 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  36.92 
 
 
113 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  40 
 
 
112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  36.92 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  39.39 
 
 
74 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  39.39 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  39.39 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  39.39 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  38.46 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  37.88 
 
 
117 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  33.85 
 
 
112 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  37.88 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  35.19 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>