54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0431 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  100 
 
 		 116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  57.89 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2749  hypothetical protein  46.85 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1678  HicB  46.43 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  45.87 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2907  HicB family protein  45.61 
 
 		 117 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2668  HicB family protein  45.95 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3189  HicB family protein  44.74 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.604003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3899  hicB protein  44.44 
 
 		 110 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27840  HicB protein  42.86 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  45.63 
 
 		 111 aa  103  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  42.31 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  37.5 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  41.35 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  41.35 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0435  HicB family protein  35.71 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  38.46 
 
 		 110 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2250  HicB family protein  39.6 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2260  HicB family protein  39.6 
 
 		 110 aa  90.5  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  41.58 
 
 		 105 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2191  HicB family protein  39.6 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4479  HicB family protein  36.19 
 
 		 112 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000336163  normal  0.448324 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4586  HicB family protein  37.14 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3197  HicB  38.78 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  41.77 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3853  HicB family protein  35.92 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2572  HicB family protein  31.48 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0281  hypothetical protein  56.67 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00676496  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1716  hypothetical protein  46.15 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00129927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0180  HicB  34.62 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5347  HicB family protein  34.65 
 
 		 109 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1110  HicB-related protein  33.98 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2720  HicB family protein  46.97 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0036  HicB-related protein  37.5 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4425  HicB-related protein  37.5 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000112957  normal  0.138894 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4402  HicB-related protein  37.5 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.380526 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4608  HicB-related protein  37.5 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.72402 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3746  HicB family protein  42.19 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.826939  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3692  HicB family protein  42.19 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  31.73 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1426  HicB family protein  29.36 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0421  HicB-related protein  29.36 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0621  HicB family protein  29.7 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754736  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  30 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1368  HicB family protein  25 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1697  hypothetical protein  24.76 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10162  normal  0.0559982 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  34.78 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  29.09 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  28.85 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  28.85 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  38.3 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  24.53 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  26.6 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>