24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0163 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  100 
 
 
107 aa  223  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  71.84 
 
 
109 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  64.49 
 
 
108 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  64.49 
 
 
108 aa  146  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  66.67 
 
 
113 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  35.92 
 
 
122 aa  58.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  33.67 
 
 
113 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  30.3 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  39.44 
 
 
121 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  38.03 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  48.84 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  32.39 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  33 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  28.3 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  31.25 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  32.29 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  34.78 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  29.25 
 
 
110 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  45.65 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  28.43 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  29.63 
 
 
118 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  41.86 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  50 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  31.73 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>