41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0443 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  100 
 
 		 118 aa  246  9e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  55.86 
 
 		 113 aa  141  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  31.73 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  35.79 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  33.33 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  32.35 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30660  Conserved hypothetical protein, HicB- family  29.91 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  30.3 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  37.14 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4138  HicB family protein  31.43 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  30.1 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  27.59 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1479  hicB protein  31.43 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5179  HicB family protein  30.19 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4242  HicB family protein  30.48 
 
 		 110 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0280  HicB family protein  29.73 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.073142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  26.47 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  31.18 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  30.26 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  27.05 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0020  HicB family protein  28.43 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000476189  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  30 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4182  hypothetical protein  27.18 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.270938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  28.57 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  30.36 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  30.16 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  32.76 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2214  hypothetical protein  43.48 
 
 		 111 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.44571  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  30.19 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  30.51 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  26.23 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  31.03 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0249  hypothetical protein  29.69 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0740061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3122  hypothetical protein  31.75 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000326959  normal  0.802699 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  27.59 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0547  hypothetical protein  30 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000844189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0431  HicB family protein  26.6 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2425  HicB family protein  33.33 
 
 		 83 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>