78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1957 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 70 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  98.57 
 
 		 70 aa  140  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  75.76 
 
 		 74 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  62.86 
 
 		 70 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  64.18 
 
 		 69 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  58.57 
 
 		 70 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  60.56 
 
 		 71 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  57.75 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  55.88 
 
 		 70 aa  84.3  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  55.88 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  50.98 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  40.32 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  43.08 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  46.15 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4121  protein of unknown function UPF0150  42.19 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4161  protein of unknown function UPF0150  42.19 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.49192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  42.25 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  48.08 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  38.71 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  42.62 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  40.68 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  34.33 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  36.54 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0249  hypothetical protein  38.46 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0740061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  35.82 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  40.38 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  48 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  37.93 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2178  hypothetical protein  39.68 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3122  hypothetical protein  36.36 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000326959  normal  0.802699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  39.22 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2528  hypothetical protein  31.03 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1513  protein of unknown function UPF0150  35.38 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1540  protein of unknown function UPF0150  35.38 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.0277095 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  47.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  40.62 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  33.87 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  33.87 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  40 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  35.09 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  36.51 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  35.48 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  38.33 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  38.71 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0651  protein of unknown function UPF0150  32.81 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  40.68 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  32.08 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  36.84 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0547  hypothetical protein  38.46 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000844189  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  34.92 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  31.25 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  33.93 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1635  hypothetical protein  31.67 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  35.82 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  37.74 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  45.1 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  30.91 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3129  protein of unknown function UPF0150  37.31 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.28092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  33.87 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  35 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  34.92 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  32.81 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  39.66 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  32.81 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  31.03 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  32.84 
 
 		 113 aa  41.2  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  37.21 
 
 		 55 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  36.73 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1588  hypothetical protein  27.87 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1482  hypothetical protein  30.51 
 
 		 134 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0778117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>