138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2743 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  241  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  56.52 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  54.78 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  53.33 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  42.98 
 
 
187 aa  107  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  43.52 
 
 
121 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  47.17 
 
 
122 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  42.59 
 
 
121 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  59.38 
 
 
133 aa  89.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  38.18 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  38.94 
 
 
130 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 
121 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  39.42 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  38.68 
 
 
113 aa  79.7  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  36.61 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  48.39 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  47.69 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0463  hypothetical protein  50 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2098  hypothetical protein  49.18 
 
 
77 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  43.94 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  31.97 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  29.46 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  48.08 
 
 
69 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  46.43 
 
 
71 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  46.43 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  32.03 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01395  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.73 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2208  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
136 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1522  hypothetical protein  32.73 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1617  DNA-binding protein  32.73 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  44.9 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01406  hypothetical protein  32.73 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2221  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1736  hypothetical protein  30.36 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335135  hitchhiker  0.00000000000538292 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2043  hypothetical protein  30.36 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00057688  hitchhiker  0.0000000000000165138 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  38.6 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  38.03 
 
 
145 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  44.23 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 
81 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  47.92 
 
 
68 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1857  hypothetical protein  31.86 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000260993  unclonable  3.98436e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  44.23 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  47.92 
 
 
68 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  40.62 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  34.33 
 
 
98 aa  50.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  38.33 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  29.52 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  35 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  36.46 
 
 
108 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  26.83 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  35.59 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  37.29 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  38.1 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  34.83 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  47.83 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  47.83 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0019  protein of unknown function UPF0150  38.1 
 
 
93 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0272418  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  46.81 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  36.17 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  44.68 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0010  hypothetical protein  33.33 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  40.74 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  31.15 
 
 
69 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  28.35 
 
 
136 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  34.85 
 
 
142 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  44.68 
 
 
134 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  31.03 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  40 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  34.48 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  42.19 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  29.23 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  33.82 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  37.04 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  42.22 
 
 
68 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  48.78 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  40.74 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  48.78 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2591  HicB  40 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.887036  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  37.7 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  36.51 
 
 
72 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  32.2 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  33.9 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  36.51 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  52.63 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0150  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  27.78 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  48.65 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>