48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1835 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1835  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000086332  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1016  protein of unknown function UPF0150  37.59 
 
 
138 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1959  hypothetical protein  35.07 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1837  hypothetical protein  35.11 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2253  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0842095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2027  protein of unknown function UPF0150  31.34 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  33.85 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1660  hypothetical protein  29.32 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1450  protein of unknown function UPF0150  29.32 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3434  hypothetical protein  29.32 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3792  hypothetical protein  29.32 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0190281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3432  hypothetical protein  32.33 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000618891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3513  hypothetical protein  29.32 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2094  protein of unknown function UPF0150  30.08 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000245077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1551  hypothetical protein  32.09 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3797  hypothetical protein  33.9 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1569  hypothetical protein  32.35 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0882026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1157  hypothetical protein  27.82 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  39.71 
 
 
145 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  32.32 
 
 
98 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  31.31 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2537  hypothetical protein  28.1 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00219291  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  30.56 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  28.97 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  24.03 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  28.47 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  30.19 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4023  protein of unknown function UPF0150  30.38 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  31.03 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  32.08 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  31.48 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1218  hypothetical protein  28 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  40.91 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  28.37 
 
 
131 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  36.51 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  36.51 
 
 
72 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  32.69 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  28.8 
 
 
134 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  40.82 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2608  protein of unknown function UPF0150  33.87 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20418  normal  0.169023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2907  hypothetical protein  33.85 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  27.69 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  38.57 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3983  hypothetical protein  29.07 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.959866  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  31.75 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>