66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0572 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  42.98 
 
 		 118 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  45.54 
 
 		 130 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  42.5 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  42.5 
 
 		 121 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  46.22 
 
 		 121 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  41.94 
 
 		 135 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  40.98 
 
 		 147 aa  95.5  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  44.44 
 
 		 113 aa  95.1  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  39.5 
 
 		 135 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  37.1 
 
 		 138 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  40.54 
 
 		 116 aa  84.7  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  37.5 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  41.94 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  44.07 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  51.92 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  51.92 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  28.24 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4206  HicB family protein  40 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  31.82 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  31.78 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0003  HicB  33 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4167  HicB family protein  39 
 
 		 108 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  38.98 
 
 		 69 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  25.38 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  46 
 
 		 70 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 		 70 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 		 70 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  44.83 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  47.27 
 
 		 72 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  44 
 
 		 75 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3668  HicB family protein  48.94 
 
 		 113 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0468154  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  48.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  36.54 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  49.02 
 
 		 56 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  49.02 
 
 		 56 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  57.5 
 
 		 67 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  43.14 
 
 		 69 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  40.82 
 
 		 68 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 		 74 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 76 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  40.82 
 
 		 68 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 		 70 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0443  HicB family protein  37.5 
 
 		 118 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134011  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2098  hypothetical protein  39.34 
 
 		 77 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  52.38 
 
 		 67 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  52.38 
 
 		 67 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  45.65 
 
 		 73 aa  45.1  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2545  protein of unknown function UPF0150  25.37 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0163  HicB family protein  45.65 
 
 		 107 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  36 
 
 		 74 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  31.25 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  39.13 
 
 		 71 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0463  hypothetical protein  35.06 
 
 		 119 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  33.85 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  39.13 
 
 		 71 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0059  HicB family protein  33.33 
 
 		 108 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 70 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2750  HicB family protein  39.66 
 
 		 109 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  34.38 
 
 		 142 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2139  HicB family protein  42.59 
 
 		 113 aa  41.2  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  27.47 
 
 		 137 aa  40.8  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1526  protein of unknown function UPF0150  51.61 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>