30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0384 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0384  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  232  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.758655  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  63.06 
 
 		 119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1472  hypothetical protein  55.56 
 
 		 116 aa  119  9e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0619  hypothetical protein  48.7 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0263664  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  56 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2034  hypothetical protein  41.53 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000850419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  39.77 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  38.64 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  40.23 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  37.36 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  31.82 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1738  hypothetical protein  29.77 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.429659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  35.87 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  36.9 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  34.83 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  34.38 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2018  hypothetical protein  30.91 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176449  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  32.97 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  30.86 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  35.63 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  28.1 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1029  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.217343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  29.69 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2098  hypothetical protein  37.5 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  32.84 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  29.03 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  30.65 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4060  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 		 71 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>