69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1973 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  147  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  70.59 
 
 		 70 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  69.01 
 
 		 71 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  61.76 
 
 		 72 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  60.56 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  60.56 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  54.93 
 
 		 70 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  55.07 
 
 		 70 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  56.92 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  61.19 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0271  hypothetical protein  39.44 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  47.17 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  34.92 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  39.34 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  43.75 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  38.18 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  52 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  43.14 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  35 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  34.85 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  35.59 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  35.48 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  32.81 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  32.81 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  41.18 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  41.94 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  36.54 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  33.87 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  46.67 
 
 		 57 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  47.62 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  47.62 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  36.36 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0789  hypothetical protein  37.04 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4320  hypothetical protein  41.67 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.736754  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  36.21 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  33.9 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  41.07 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  41.07 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3215  protein of unknown function UPF0150  31.43 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304622 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  44.44 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4378  protein of unknown function UPF0150  34.43 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000452582  unclonable  0.00000000142401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4316  protein of unknown function UPF0150  34.43 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 74 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  35.09 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4121  protein of unknown function UPF0150  28.12 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  40.35 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4161  protein of unknown function UPF0150  28.12 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.49192 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0376  protein of unknown function UPF0150  33.87 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.586857  normal  0.0103099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  35.42 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  36.21 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  36.54 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2272  hypothetical protein  39.68 
 
 		 69 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2020  hypothetical protein  40.48 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1513  protein of unknown function UPF0150  26.03 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0249  hypothetical protein  29.23 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0740061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1540  protein of unknown function UPF0150  26.03 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.0277095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2356  hypothetical protein  40.48 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0990  hypothetical protein  35.59 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000238527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  31.88 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  35.59 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  31.25 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  31.67 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 134 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>