88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1487 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
65 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  59.32 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2300  hypothetical protein  55.93 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  52.54 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  47.69 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1425  protein of unknown function UPF0150  60 
 
 
135 aa  67  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000416258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0842  hypothetical protein  56.36 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3460  protein of unknown function UPF0150  46.77 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  45.16 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0572  hypothetical protein  44.07 
 
 
187 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000321015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  45.61 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3322  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742622  normal  0.222376 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0609  hypothetical protein  48 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000794304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2098  hypothetical protein  52.63 
 
 
77 aa  52  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1953  protein of unknown function UPF0150  40.68 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  46 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1973  hypothetical protein  52 
 
 
71 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.193383  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  46.15 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1945  protein of unknown function UPF0150  48 
 
 
70 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  37.5 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  37.29 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  43.64 
 
 
78 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1957  protein of unknown function UPF0150  48 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.516123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  40.68 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  49.09 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0838  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0866  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  39.34 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  42.31 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  46 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  37.25 
 
 
74 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  39.06 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  54.29 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1593  protein of unknown function UPF0150  42.37 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  55.26 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  38.46 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  55.26 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  35.29 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  54.29 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  45.24 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0171  hypothetical protein  37.7 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  45.24 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 
68 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  44.07 
 
 
121 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  51.06 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0218  hypothetical protein  42.31 
 
 
72 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2645  hypothetical protein  40.68 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  37.7 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0784  protein of unknown function UPF0150  37.74 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.721186  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  41.3 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  51.35 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  34.43 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  51.35 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  40.38 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  47.92 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  42 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0078  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  37.7 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000322202 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6579  hypothetical protein  41.67 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000147434  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0595  protein of unknown function UPF0150  41.27 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795214  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4387  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 
56 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.865674  hitchhiker  0.0000000461931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  38.98 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4325  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 
56 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  36.36 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1469  protein of unknown function UPF0150  34.69 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0135  CopG family transcriptional regulator  39.06 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1496  protein of unknown function UPF0150  34.69 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815263  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0564  toxin-antitoxin system, antitoxin component, HicB family  45.24 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00598996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1332  hypothetical protein  37.5 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80599  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0168  hypothetical protein  38.98 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333763  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3799  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 
136 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  41.67 
 
 
138 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0299  hypothetical protein  46 
 
 
113 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.046828  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2076  protein of unknown function UPF0150  43.18 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.297925  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  47.92 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  51.43 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  39.06 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0947  hypothetical protein  32.2 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  46.67 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  36 
 
 
72 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  39.22 
 
 
68 aa  40.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  42.22 
 
 
71 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  42.22 
 
 
71 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>