57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4509 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 
67 aa  137  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  98.51 
 
 
67 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  58.82 
 
 
67 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  58.82 
 
 
67 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  51.52 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  41.79 
 
 
67 aa  57.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1469  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1496  protein of unknown function UPF0150  41.18 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815263  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  37.31 
 
 
72 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1740  hypothetical protein  37.31 
 
 
66 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0186698  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  45.65 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  47.83 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  45.83 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  42.42 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  40.98 
 
 
79 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  40.98 
 
 
79 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  44.68 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  40.68 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  45.83 
 
 
72 aa  47.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  48.84 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  48.84 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  48.89 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  40.35 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  43.4 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  45.83 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  45.83 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1487  protein of unknown function UPF0150  51.35 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  48 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  48 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  44.68 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  40.98 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  40.98 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  43.48 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  40 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  46.67 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  39.58 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0797  protein of unknown function UPF0150  48.72 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  40.82 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  40.82 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  42 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 
68 aa  43.5  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  44.68 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0481  hypothetical protein  38.3 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000325611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  39.58 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  39.68 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  35.19 
 
 
135 aa  42  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  42.11 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0878  protein of unknown function UPF0150  47.5 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336866  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0851  protein of unknown function UPF0150  47.5 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  41.03 
 
 
55 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  41.67 
 
 
66 aa  40  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  48.84 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1541  hypothetical protein  43.59 
 
 
56 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  34.04 
 
 
75 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>